AWS HealthOmics が Nextflow ワークフロー用リソースフォールバック順序を導入
AWS HealthOmics は Nextflow ワークフローでリソースフォールバック指令を導入し、研究者やバイオインフォマティシャンが加速度器の制約による実行の診断と再提出を減らし、生産ワークフローを継続できるようにする
本日、AWS HealthOmics は Nextflow ワークフローのタスク用リソースフォールバック指令を導入した。この指令により、研究者やバイオインフォマティシャンは優先する加速度器タイプの順序付きリストを定義でき、CPU インスタンスへのフォールバックオプションも含めることができる。これにより、加速度器の制約による実行の診断と再提出にかかる時間を減らし、生産ワークフローを継続できる。AWS HealthOmics は HIPAA 対応サービスで、医療およびライフサイエンスの顧客が完全に管理されたバイオインフォマティクスワークフローで科学的ブレイクスルーを大規模に加速するのに役立つ。Nextflow ワークフロー用リソースフォールバックでは、優先する加速度器を優先できる。優先する加速度器が利用できない場合、HealthOmics は再提出せずにフォールバックの指定された代替を自動的に移動する。各加速度器プロファイルには設定可能なタイムアウトがあり、HealthOmics がその加速度器を検索する時間を制御できる。より短いタイムアウトはフォールバック順序を素早く移動するのに役立ち、より長いタイムアウトは優先加速度器を確保する確率を高める。CPU プロファイルを最終フォールバックとして含めることで、タスクがインスタンスを確保する可能性を高めることもできる。Nextflow ワークフロー用リソースフォールバックは、AWS HealthOmics のすべてのリージョンで使用できる：US East (N. Virginia, Ohio)、US West (Oregon)、Europe (Frankfurt, Ireland, London)、Israel (Tel Aviv)、Asia Pacific (Seoul, Singapore, Tokyo)。詳細については、高度なリソース構成と Nextflow の詳細ドキュメントを参照してください。
この更新の位置づけ
AWS HealthOmics は、医療およびライフサイエンスの顧客が完全に管理されたバイオインフォマティクスワークフローで科学的ブレイクスルーを大規模に加速するのに役立つ HIPAA 対応サービスである。この更新は、研究者やバイオインフォマティシャンが加速度器の制約による実行の診断と再提出を減らし、生産ワークフローを継続できるようにする。